挑选种兔要耐心细致，凡是不符合本品种外貌特征的，一定不能做种用。有各种生理缺陷或畸形的，不管是先天性的还是后天性的，同样都不能做种用。常见的畸形有如下几种：
门齿过长
也叫下颌颚突畸形。有的家兔下门齿向斜上方长出，像倒长的象牙，而上门齿却向嘴里长，变得长而弯曲，就像羊犄角一样，严重影响家兔采食，采食长草更加困难，还容易刺破上颗和齿龈。
八字腿
两只腿向斜前方伸出，呈八字形，迈步较困难。八字腿有先天性的，也有后天性的。先天性的会遗传，后天性的是由于营养不良（钙磷比例不合适），管理不当（自幼生活在过于光滑的底网上，身体重心变位，造成腿骨骼畸形）等造成的。不管是先天性的还是后天性的，都不能做种用。
垂尻
有的家兔尻部太斜，配种很不方便，而且外形也不美观，不宜留做种用。
垂耳
少数品种的兔耳朵是下垂的，这是本品种固有的特征，如法国垂耳兔、英国垂耳兔、荷兰垂耳兔，但就多数品种而言，家兔的两耳是直立的，由于遗传或后天原因，出现一个或两个耳下垂，这就属于缺陷，不宜做种用。
另外，公兔隐睾、单睾或小睾丸，阴部畸形公母难分，母兔乳头过少等，均不宜留做种用。
